80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1865 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1865  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 
67 aa  135  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0959115  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1275  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.73 
 
 
67 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106306  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1179  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 
67 aa  62  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 
66 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
70 aa  55.1  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0073  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  34.85 
 
 
329 aa  54.7  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
75 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
66 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  33.33 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  34.85 
 
 
70 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.88 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  38.81 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  34.85 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
67 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  38.71 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0808  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  34.92 
 
 
64 aa  46.2  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 
67 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 
162 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.87 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.87 
 
 
63 aa  43.5  0.0009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.92 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0338  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  25.37 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 
98 aa  42.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  25.76 
 
 
374 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  30.3 
 
 
347 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1503  ThiS, thiamine-biosynthesis  27.54 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.65 
 
 
66 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1634  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 
65 aa  41.6  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 
65 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0647  sulfur carrier protein ThiS  31.34 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13201  hypothetical protein  31.43 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2093  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  26.87 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19401  hypothetical protein  29.23 
 
 
70 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.952724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  36 
 
 
331 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  30.65 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  24.24 
 
 
66 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>