38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2093 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2093  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 69 aa  133  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2320  thiamine biosynthesis protein ThiS  52 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.608129  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2436  thiamine biosynthesis protein ThiS  52 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0745874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2025  thiamine biosynthesis protein ThiS  52 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1925  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.98 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2027  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.02 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1939  thiamine biosynthesis protein ThiS  52 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2442  thiS protein, putative  50 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2094  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2198  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259042  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1884  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2380  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.14 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00143  sulfur carrier protein ThiS  30.43 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2016  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.509039 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  35.82 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2986  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  39.71 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  38.24 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 		 66 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 		 66 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 		 66 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1865  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0959115  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  35.82 
 
 		 331 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.9 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  35.48 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  35.48 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  35.48 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  35.48 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  32.26 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>