43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00143 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00143  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 		 69 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2442  thiS protein, putative  33.33 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1884  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1939  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2094  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2093  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.43 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1925  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2027  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2025  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2436  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0745874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2320  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.608129  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  31.82 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  26.09 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  43.9  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  43.9  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  29.85 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  28.79 
 
 		 66 aa  43.9  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  43.9  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2986  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 		 70 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 71 aa  40.8  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  33.82 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 71 aa  40.8  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000134216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  25.76 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  32.35 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 		 66 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 62 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>