41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1925 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1925  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 67 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2320  thiamine biosynthesis protein ThiS  94.03 
 
 		 67 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.608129  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2436  thiamine biosynthesis protein ThiS  94.03 
 
 		 67 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0745874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2025  thiamine biosynthesis protein ThiS  94.03 
 
 		 67 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2027  thiamine biosynthesis protein ThiS  91.04 
 
 		 67 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2442  thiS protein, putative  62.69 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1939  thiamine biosynthesis protein ThiS  61.19 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1884  thiamine biosynthesis protein ThiS  59.7 
 
 		 67 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2094  thiamine biosynthesis protein ThiS  58.21 
 
 		 67 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.25 
 
 		 72 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2016  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.509039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2198  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259042  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2380  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2093  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.98 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00143  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1747  ThiS  32.84 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  29.69 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  29.69 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  32.81 
 
 		 326 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  32.26 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.69 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  34.38 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  32.81 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  29.69 
 
 		 326 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0895  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.64 
 
 		 72 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.69 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  28.12 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  26.87 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  29.69 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.69 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  32.81 
 
 		 66 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 75 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>