69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1857 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 67 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.27 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2027  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2320  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.608129  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2436  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0745874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2025  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1925  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2380  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.86 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2442  thiS protein, putative  37.31 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  28.36 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  28.36 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2093  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2094  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1884  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2986  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.87 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.26 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  35.48 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  30.3 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.26 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1939  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.43 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  31.34 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  37.31 
 
 		 327 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  29.03 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0895  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.43 
 
 		 72 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  31.82 
 
 		 75 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1143  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2198  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 75 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>