52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1143 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1143  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 70 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.72 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2538  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.06 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.694439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4110  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.06 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.7 
 
 		 71 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2239  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.86 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.423585 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1185  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.76 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.029771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1981  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00036905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1567  ThiS, thiamine-biosynthesis  44.29 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0927969  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  38.81 
 
 		 329 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 211 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 63 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1679  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000223825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0338  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  32.84 
 
 		 326 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  32.84 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  35.82 
 
 		 331 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  34.92 
 
 		 374 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1841  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.31 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.21 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1135  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.477207  normal  0.0493363 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  35.38 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 78 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0841  ThiS, thiamine-biosynthesis  47.5 
 
 		 72 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0895  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.72 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16951  hypothetical protein  47.5 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.277619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.43 
 
 		 68 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.23 
 
 		 78 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1158  sulfur transfer protein for thiamine biosynthesis  37.88 
 
 		 65 aa  40.4  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 75 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>