82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0841 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0841  ThiS, thiamine-biosynthesis  100 
 
 
72 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16951  hypothetical protein  90.28 
 
 
71 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.277619  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19401  hypothetical protein  48.57 
 
 
70 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.952724 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13201  hypothetical protein  44.29 
 
 
70 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.28 
 
 
70 aa  68.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14741  hypothetical protein  47.83 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214043  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14601  hypothetical protein  47.83 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1369  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.28 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0915348  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  47.76 
 
 
70 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1503  ThiS, thiamine-biosynthesis  44.29 
 
 
72 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 
75 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 
75 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  47.83 
 
 
70 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0895  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 
72 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.27 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  42.03 
 
 
80 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14361  hypothetical protein  47.83 
 
 
69 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  40.58 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.48 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1179  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  38.89 
 
 
329 aa  50.1  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  37.68 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 
66 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 
66 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 
75 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0073  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1143  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193117  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.43 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1275  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106306  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
66 aa  44.3  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  30.43 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  32.39 
 
 
326 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1567  ThiS, thiamine-biosynthesis  35.71 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0927969  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1841  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  31.88 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1656  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.78 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0368  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.37 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000158622  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  31.88 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.72 
 
 
71 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0338  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 
67 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.78 
 
 
98 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  40.28 
 
 
67 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
67 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  39.47 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.74 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  39.47 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  39.47 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  39.47 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  39.47 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  39.47 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.38 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  39.47 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1865  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.99 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0959115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 
211 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  33.33 
 
 
347 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.14 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  37.68 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.43 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  34.78 
 
 
331 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  39.47 
 
 
67 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>