61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1179 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1179  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 67 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1865  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 		 67 aa  62  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0959115  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 70 aa  57  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  43.28 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  34.85 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0073  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1275  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106306  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  34.85 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0808  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  34.38 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0338  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  34.38 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  42.42 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  26.56 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16951  hypothetical protein  35.29 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.277619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0841  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.78 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  38.71 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  37.5 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1158  sulfur transfer protein for thiamine biosynthesis  37.5 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  27.27 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  31.25 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 65 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0802  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.961569  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1656  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.29 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.04 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  31.82 
 
 		 347 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0205  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  38.57 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000222136  decreased coverage  0.0000121699 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0225  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 		 66 aa  40  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00707568  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>