124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1455 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  149  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.94 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  36.36 
 
 		 347 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.77 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.55 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3007  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.88 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  61.11 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  61.11 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  61.11 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  61.11 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  61.11 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  61.11 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  61.11 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  36.36 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0798  putative ThiS sulfur transfer protein  41.07 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  55.56 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  58.33 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  55.56 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1459  hypothetical protein  36.36 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3509  sulfur carrier protein ThiS  55.56 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.20038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0164  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2696  sulfur carrier protein ThiS  55.56 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  55.56 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2093  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0390  sulfur carrier protein ThiS  55.56 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  55.56 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  36 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.99 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  55.56 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.55 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1524  hypothetical protein  34.85 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  38.71 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.71 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0329  sulfur carrier protein ThiS  52.78 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0338  sulfur carrier protein ThiS  52.78 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518448  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.71 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0204  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1179  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2380  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.14 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  42  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.29 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.85 
 
 		 98 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 65 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 67 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.29 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.05 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>