42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1524 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1524  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  140  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1459  hypothetical protein  88.06 
 
 		 67 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.52 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1747  ThiS  35.82 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0204  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.65 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.38 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  44 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  28.79 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.38 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1933  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  44 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  35.82 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.43 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  34 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  34 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  25.76 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  25.76 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0444  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  34.85 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0798  putative ThiS sulfur transfer protein  40 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  25.76 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0252  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.86 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2442  thiS protein, putative  29.85 
 
 		 67 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  36.54 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.57 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 65 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  24.24 
 
 		 65 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 		 92 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>