94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0620 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 67 aa  134  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  46.27 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  43.28 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  46.27 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.31 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.08 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 66 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.9 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.21 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  31.34 
 
 		 347 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  41.79 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.9 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1524  hypothetical protein  32.35 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.21 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  30.88 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.75 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  28.36 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  33.82 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.74 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  30.88 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  30.88 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  30.88 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  30.88 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  30.88 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  30.88 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  31.34 
 
 		 65 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  29.85 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  29.85 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.99 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  29.85 
 
 		 66 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1922  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.589844  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  26.87 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  32.84 
 
 		 326 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  29.85 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  29.85 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  29.85 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 		 66 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  27.69 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000134216 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1459  hypothetical protein  27.94 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  27.69 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.53 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  29.85 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  29.85 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  29.85 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  29.85 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  30.88 
 
 		 327 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>