77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3873 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 66 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  72.73 
 
 		 66 aa  98.6  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  69.7 
 
 		 66 aa  94.4  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  68.18 
 
 		 66 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  69.7 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  57.58 
 
 		 66 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  54.55 
 
 		 66 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  77  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  57.58 
 
 		 71 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  57.58 
 
 		 71 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000134216 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  59.09 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  54.55 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  54.55 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  54.55 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  54.55 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  54.55 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  51.52 
 
 		 66 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0363  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  38.81 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2986  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1747  ThiS  34.38 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  34.33 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  30.3 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.94 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1185  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.029771  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2442  thiS protein, putative  35.94 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1939  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  34.33 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  33.33 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 		 67 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  30.3 
 
 		 67 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2094  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 67 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1884  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1830  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.58 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.6474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00143  sulfur carrier protein ThiS  29.41 
 
 		 69 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>