52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1604 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 68 aa  136  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.65 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 		 66 aa  52  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  37.68 
 
 		 327 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  41.18 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.29 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.29 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  33.82 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  32.35 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 64 aa  42.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  33.33 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  32.35 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.39 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  32.35 
 
 		 66 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  32.35 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  32.35 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  32.35 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  30.88 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  32.35 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  36.23 
 
 		 67 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 65 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 69 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 67 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  33.96 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  33.96 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000134216 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.51 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  26.47 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2198  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.44 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259042  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  30.88 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.78 
 
 		 70 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>