71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2465 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 66 aa  137  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0363  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 		 68 aa  52  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  35.82 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  33.33 
 
 		 347 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.44 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.99 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.96 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  30.3 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  30.3 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  28.79 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  32.81 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000134216 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  32.81 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0085  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.31 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.171422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.59 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0731  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  32.84 
 
 		 327 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1555  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  31.82 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 72 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.03 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2002  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00143  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.24 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>