89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0363 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0363  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 66 aa  134  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  40.91 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  45.31 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  45.31 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000134216 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 84 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  40.91 
 
 		 347 aa  55.1  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2198  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.18 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259042  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2986  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.05 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  33.33 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.65 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.65 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00143  sulfur carrier protein ThiS  30.65 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  33.82 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 71 aa  42  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  26.56 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  31.34 
 
 		 327 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.67 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.95 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 67 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0444  sulfur carrier protein ThiS  37.68 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.24 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  30.3 
 
 		 329 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0338  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518448  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0894  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0249295  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 70 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 78 aa  40  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>