79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0666 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 70 aa  140  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2002  thiamine biosynthesis protein ThiS  64.29 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0731  thiamine biosynthesis protein ThiS  65.67 
 
 		 67 aa  92.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1266  ThiS, thiamine-biosynthesis  52.24 
 
 		 67 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1564  ThiS, thiamine-biosynthesis  50.75 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0619282 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1555  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.11 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  34.29 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2538  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.694439  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.86 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.03 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1608  sulfur transfer protein  34.92 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  35.48 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  34.29 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0808  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  40.62 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 75 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1679  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000223825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  31.82 
 
 		 326 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  34.43 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  26.87 
 
 		 67 aa  40  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 65 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>