51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0731 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0731  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 
67 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2002  thiamine biosynthesis protein ThiS  71.64 
 
 
86 aa  99.4  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  65.67 
 
 
70 aa  92.8  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1564  ThiS, thiamine-biosynthesis  58.21 
 
 
67 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0619282 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1266  ThiS, thiamine-biosynthesis  58.21 
 
 
67 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1555  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.73 
 
 
67 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 
74 aa  54.7  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
211 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.38 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  46.38 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  46.38 
 
 
93 aa  47  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
72 aa  47  0.00009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  39.06 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  31.82 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1608  sulfur transfer protein  34.92 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156932  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  37.5 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  32.84 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
78 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  38.81 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  35.48 
 
 
64 aa  40.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  39.68 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  35.94 
 
 
347 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>