131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0612 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 
67 aa  135  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  73.13 
 
 
67 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  46.27 
 
 
66 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  46.27 
 
 
66 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  47.76 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0647  sulfur carrier protein ThiS  49.25 
 
 
67 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 
66 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  46.27 
 
 
71 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.06 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.76 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 
66 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  43.28 
 
 
66 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.27 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  43.28 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 
66 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  40.3 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 
211 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  43.28 
 
 
326 aa  52.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  41.79 
 
 
347 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 
66 aa  52  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.97 
 
 
162 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
73 aa  50.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  44.78 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  38.81 
 
 
329 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  35.82 
 
 
327 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.62 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  32.84 
 
 
67 aa  47  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 
65 aa  47.4  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 
68 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.44 
 
 
72 aa  47  0.00009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2519  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  38.81 
 
 
374 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1432  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0567426  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  34.33 
 
 
331 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1135  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.477207  normal  0.0493363 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1334  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0203428  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1856  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 
64 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1573  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 
64 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 
73 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1185  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.029771  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0329  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 
74 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  36.92 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  38.81 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>