75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0643 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 73 aa  150  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1143  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.72 
 
 		 70 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1567  ThiS, thiamine-biosynthesis  50.72 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0927969  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.93 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2538  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.3 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.694439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2239  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.38 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.423585 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4110  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1185  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.029771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1981  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.93 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00036905  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  41.18 
 
 		 329 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1679  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000223825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  32.35 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  32.35 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  36.76 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.43 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.94 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.29 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.94 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.43 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  33.82 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  39.13 
 
 		 327 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  33.82 
 
 		 331 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.57 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  33.82 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 66 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  33.82 
 
 		 66 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.86 
 
 		 70 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1135  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 		 66 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.477207  normal  0.0493363 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 66 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 63 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  36.23 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  33.82 
 
 		 374 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  36.23 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.43 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.14 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  30.88 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0338  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  26.47 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2519  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  36.23 
 
 		 66 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.86 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 		 67 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 		 67 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 		 67 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 		 67 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 		 67 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 		 67 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 		 67 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>