55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2239 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2239  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 70 aa  141  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.423585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1981  thiamine biosynthesis protein ThiS  95.71 
 
 		 70 aa  135  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00036905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1567  ThiS, thiamine-biosynthesis  61.43 
 
 		 70 aa  92.8  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0927969  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  65.71 
 
 		 71 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2538  thiamine biosynthesis protein ThiS  57.97 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.694439  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1185  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.28 
 
 		 69 aa  70.1  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.029771  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1143  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.86 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.38 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4110  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.38 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.48 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  43.48 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0252  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.68 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0085  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.171422  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  42.03 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.14 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  37.14 
 
 		 331 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  40.58 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  40.58 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  40.58 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  40.58 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  40.58 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  40.58 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  40.58 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  41.1 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0647  sulfur carrier protein ThiS  40.58 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.21 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  37.68 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  35.21 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13201  hypothetical protein  37.14 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  36.23 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  37.68 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  37.68 
 
 		 66 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 		 67 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  37.68 
 
 		 66 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  37.68 
 
 		 66 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.89 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.89 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  33.33 
 
 		 347 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  31.88 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 78 aa  41.2  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 66 aa  40.4  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>