26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4110 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4110  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 85 aa  169  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2538  thiamine biosynthesis protein ThiS  62.32 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.694439  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1143  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.06 
 
 		 70 aa  70.1  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1185  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.24 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.029771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.28 
 
 		 71 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1567  ThiS, thiamine-biosynthesis  50.72 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0927969  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1981  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.38 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00036905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2239  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.38 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.423585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1135  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.477207  normal  0.0493363 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1679  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000223825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  29.41 
 
 		 347 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 66 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  35.71 
 
 		 327 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  29.85 
 
 		 329 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.31 
 
 		 72 aa  40  0.01  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>