77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0072 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 78 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1679  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.54 
 
 		 66 aa  70.1  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000223825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.31 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1135  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.477207  normal  0.0493363 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.07 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 70 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.94 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.15 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  31.34 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  31.82 
 
 		 326 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1662  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000426635  hitchhiker  0.000995096 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19401  hypothetical protein  28.99 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.952724 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0073  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.65 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  28.79 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  27.27 
 
 		 329 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14741  hypothetical protein  38.78 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214043  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  27.94 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1503  ThiS, thiamine-biosynthesis  31.48 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1369  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.3 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0915348  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  24.24 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14601  hypothetical protein  38.78 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  31.43 
 
 		 374 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0338  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1865  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0959115  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1158  sulfur transfer protein for thiamine biosynthesis  31.15 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  31.34 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  30.3 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  32.79 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14361  hypothetical protein  41.46 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.89 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13201  hypothetical protein  31.37 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1266  ThiS, thiamine-biosynthesis  30.3 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  25.76 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0895  thiamine biosynthesis protein ThiS  26.09 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0731  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0085  thiamine biosynthesis protein ThiS  21.25 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.171422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  25.76 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  26.87 
 
 		 67 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  26.87 
 
 		 67 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  26.87 
 
 		 67 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  26.87 
 
 		 67 aa  40.8  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  25.76 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  26.87 
 
 		 67 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  26.87 
 
 		 67 aa  40.8  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  26.87 
 
 		 67 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  26.47 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  29.85 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3071  thiamine biosynthesis protein ThiS  26.15 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1841  thiamine biosynthesis protein ThiS  24.24 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2002  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1143  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.23 
 
 		 70 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2538  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 69 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.694439  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  24.24 
 
 		 66 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>