31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3071 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3071  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 85 aa  160  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1841  thiamine biosynthesis protein ThiS  72.73 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0085  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.171422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  46.77 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  40.32 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  44.62 
 
 		 331 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  39.51 
 
 		 374 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  38.81 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  38.81 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.94 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  40.62 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  36.92 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1369  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0915348  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  38.46 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14741  hypothetical protein  35.29 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214043  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0040  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14601  hypothetical protein  35.29 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  26.15 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 		 70 aa  40  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>