60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_14741 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_14741  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  135  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214043  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14601  hypothetical protein  98.55 
 
 
69 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1369  thiamine biosynthesis protein ThiS  88.41 
 
 
69 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0915348  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14361  hypothetical protein  69.57 
 
 
69 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13201  hypothetical protein  46.38 
 
 
70 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19401  hypothetical protein  40.58 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.952724 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1503  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.78 
 
 
72 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0841  ThiS, thiamine-biosynthesis  47.83 
 
 
72 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16951  hypothetical protein  47.83 
 
 
71 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.277619  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.48 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.48 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  34.78 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 
66 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 
70 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0895  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
72 aa  50.8  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  42.03 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1841  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 
95 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  36.92 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.78 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  37.14 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1135  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.477207  normal  0.0493363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 
75 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  36.23 
 
 
374 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 
211 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  31.88 
 
 
329 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1679  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000223825  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  28.99 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.43 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  31.88 
 
 
326 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  36.23 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.11 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.43 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3071  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.8 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.43 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  36.23 
 
 
67 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  30.43 
 
 
67 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.57 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>