149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4278 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 66 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  86.36 
 
 		 66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  59.09 
 
 		 66 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 		 66 aa  70.1  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  53.12 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.7 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  48.48 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.31 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.38 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  46.97 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  46.97 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  46.97 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.87 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  40.91 
 
 		 326 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.31 
 
 		 78 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  36.36 
 
 		 347 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  36.36 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.33 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.44 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  33.33 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  36.36 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.85 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  33.33 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3320  sulfur carrier protein ThiS  37.68 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3644  sulfur carrier protein ThiS  37.68 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  39.39 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4884  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.29 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.5 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>