139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1773 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 72 aa  147  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2027  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.75 
 
 		 67 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2025  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.75 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2320  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.75 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.608129  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2436  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.75 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0745874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1925  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.25 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2198  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.27 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259042  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.27 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2093  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2986  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2442  thiS protein, putative  38.81 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2380  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2094  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1884  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1939  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  38.57 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  40.32 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  38.57 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.1 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00143  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 69 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  33.82 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  46.94 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.11 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1747  ThiS  29.85 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 68 aa  47.4  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 		 68 aa  47.4  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1266  ThiS, thiamine-biosynthesis  35.29 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.9 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  31.43 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000134216 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  31.43 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.14 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  44.9 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  44.9 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.26 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  44.9 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  44.9 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.9 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  34.85 
 
 		 347 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.65 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  44.9 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  44.9 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>