50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2986 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2986  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 70 aa  144  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  44.12 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  44.12 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  45.59 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  45.59 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000134216 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2198  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259042  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  63.89 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  63.89 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  63.89 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  63.89 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  63.89 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  63.89 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  63.89 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.07 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  63.89 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  63.89 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  58.33 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  33.82 
 
 		 327 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0363  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.05 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  58.33 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  55.56 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  45.1 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  55.56 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  30.3 
 
 		 347 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  52.78 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.87 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2093  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.43 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00143  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 69 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  26.87 
 
 		 67 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2442  thiS protein, putative  29.85 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1275  thiamine biosynthesis protein ThiS  23.88 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  25.76 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  26.09 
 
 		 75 aa  40.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  32.26 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.61 
 
 		 69 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>