119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34640 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 		 64 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  58.06 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.69 
 
 		 68 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.12 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  47.62 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.61 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.76 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  46.77 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.77 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.65 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.93 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.77 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.31 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.79 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  48.39 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  43.55 
 
 		 71 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  43.55 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  41.94 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  48.39 
 
 		 65 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  41.94 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  43.55 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  39.06 
 
 		 326 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.1 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.94 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  37.1 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.71 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.05 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  40.32 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.94 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  38.71 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  43.75 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2380  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  43.75 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  43.75 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0494  thiamine biosynthesis protein ThiS  58.33 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171819 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.71 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  38.71 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  40.32 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0808  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  39.06 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01730  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.79 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  38.71 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2002  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.71 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.1 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  38.71 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.84 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1266  ThiS, thiamine-biosynthesis  31.25 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1555  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  35.94 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2027  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161484 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.68 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2025  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2320  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.608129  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2436  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0745874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4884  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  33.87 
 
 		 70 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.87 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.54 
 
 		 65 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  37.5 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.65 
 
 		 66 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  28.12 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 68 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.87 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.71 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  35.48 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  27.87 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.87 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3509  sulfur carrier protein ThiS  38.71 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.20038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0731  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.71 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>