82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2224 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 69 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  55.71 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.39 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.14 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.31 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  43.28 
 
 		 331 aa  53.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  44.78 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 70 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.65 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.22 
 
 		 70 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.08 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.21 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.44 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.29 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.65 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.93 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  62.16 
 
 		 327 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.1 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  49.02 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  42.19 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  53.45 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  42.65 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.06 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.22 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  35.29 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  36.67 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  30.88 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.62 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 68 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.14 
 
 		 65 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 66 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 68 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  35 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 70 aa  40.8  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0808  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  36.62 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  50.94 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  50.94 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  50.94 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  50.94 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  50.94 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  50.94 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  50.94 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  42.65 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  30.88 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  41.18 
 
 		 67 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>