77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0913 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 64 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  67.19 
 
 		 64 aa  81.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  58.46 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.31 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  52.31 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0444  sulfur carrier protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0040  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.07 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0283  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.92 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.16 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.79 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  46.15 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.27 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3069  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0208668  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  42.42 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0731  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.75 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3007  sulfur carrier protein ThiS  38.46 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4313  thiamine biosynthesis protein ThiS  59.38 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1933  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1564  ThiS, thiamine-biosynthesis  45.16 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0619282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1747  ThiS  43.4 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 70 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  39.39 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0390  sulfur carrier protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  35.38 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  35.38 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  35.38 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  35.38 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  35.38 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  35.38 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  35.38 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2696  sulfur carrier protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  36.36 
 
 		 326 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1608  sulfur transfer protein  43.86 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  36.92 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 64 aa  40  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>