54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2563 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 65 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.85 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0444  sulfur carrier protein ThiS  49.23 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.31 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.23 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.44 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.03 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.23 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  41.54 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0040  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0283  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  42 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.27 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.44 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1524  hypothetical protein  40 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.44 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1933  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.31 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1459  hypothetical protein  38 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 67 aa  42  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  38.81 
 
 		 75 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0894  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.23 
 
 		 65 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0249295  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.92 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0225  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.51 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00707568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0205  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  29.51 
 
 		 66 aa  40  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000222136  decreased coverage  0.0000121699 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>