68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3651 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 64 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  67.19 
 
 		 64 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  60 
 
 		 65 aa  72  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.92 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  55.38 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.31 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.92 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  49.23 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0444  sulfur carrier protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0040  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  46.15 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.14 
 
 		 70 aa  52  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.03 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  46.97 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  48 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0283  thiamine biosynthesis protein ThiS  65.71 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.89 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  37.88 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1933  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1747  ThiS  46 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.89 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4313  thiamine biosynthesis protein ThiS  59.38 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.85 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1564  ThiS, thiamine-biosynthesis  48.15 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0619282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3069  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.94 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0208668  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.93 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 		 70 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>