66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1564 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1564  ThiS, thiamine-biosynthesis  100 
 
 
67 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0619282 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2002  thiamine biosynthesis protein ThiS  58.21 
 
 
86 aa  90.1  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0731  thiamine biosynthesis protein ThiS  58.21 
 
 
67 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1266  ThiS, thiamine-biosynthesis  52.24 
 
 
67 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.75 
 
 
70 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1555  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 
67 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  40.91 
 
 
347 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  47.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.48 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.94 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 
93 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.31 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1679  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000223825  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
211 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1608  sulfur transfer protein  42.86 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156932  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
65 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
73 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  43.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.44 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 
68 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.1 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.16 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
67 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
67 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
67 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
67 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
67 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
67 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
67 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
73 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
67 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  35.48 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  40 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  36.36 
 
 
326 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.15 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  36.36 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  32.84 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 
67 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1856  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.87 
 
 
64 aa  40  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1573  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.87 
 
 
64 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0171362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>