57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1555 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1555  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 67 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2002  thiamine biosynthesis protein ThiS  58.21 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1564  ThiS, thiamine-biosynthesis  50.75 
 
 		 67 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0619282 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0731  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.73 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1266  ThiS, thiamine-biosynthesis  41.79 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  37.88 
 
 		 326 aa  50.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 211 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  36.36 
 
 		 374 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2442  thiS protein, putative  32.84 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1679  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000223825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  34.38 
 
 		 326 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  35.48 
 
 		 64 aa  42.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  32.84 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1939  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 66 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 66 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1856  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 64 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1573  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 64 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0171362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  35.94 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  32.81 
 
 		 329 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2094  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.12 
 
 		 66 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>