37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2380 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2380  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 77 aa  154  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2027  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1925  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2436  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0745874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2320  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.608129  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2025  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.89 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2442  thiS protein, putative  34.29 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2094  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.86 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2093  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.14 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  34.29 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.86 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2198  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.05 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259042  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  36.11 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1884  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.43 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1939  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.43 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.29 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  34.72 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  32.86 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.86 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  31.43 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  30.3 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  31.43 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  30 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.94 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  30.14 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.8 
 
 		 70 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.96 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.96 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.78 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  27.78 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  27.78 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  27.78 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000134216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>