22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1830 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1830  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 
73 aa  148  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.6474  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  30.99 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  29.58 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  30.99 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  29.58 
 
 
71 aa  44.3  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000134216 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  29.58 
 
 
71 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.99 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  30.99 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  30.99 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  30.99 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  30.99 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  30.99 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  30.99 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  30.99 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  29.58 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  30.99 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  25.35 
 
 
66 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  28.17 
 
 
66 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.17 
 
 
66 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  28.17 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.58 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.17 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>