17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0776 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0776  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.19393 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1634  thiamine biosynthesis protein ThiS  55.38 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0073  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  32.81 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.69 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  29.69 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.23 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.42 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  29.69 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  32 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.42 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.44 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  31.25 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  25 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  38 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 66 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>