73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1457 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1457  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 
75 aa  142  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.650778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.41 
 
 
81 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.35 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.53 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0494  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  46.38 
 
 
64 aa  53.9  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  64.29 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  48.57 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.38 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.83 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.14 
 
 
68 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  64.1 
 
 
66 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
66 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.03 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  63.41 
 
 
78 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.53 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.06 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 
65 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  59.52 
 
 
67 aa  47.4  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 
75 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.63 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01730  thiamine biosynthesis protein ThiS  58.54 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  39.71 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  39.71 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  39.13 
 
 
326 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 
65 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.83 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.72 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.11 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.72 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.15 
 
 
65 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 
65 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  40.58 
 
 
70 aa  43.5  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 
77 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2320  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.608129  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2436  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0745874  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.19 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2025  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.82 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.05 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.22 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  42.03 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2027  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
67 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161484 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  27.54 
 
 
66 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 
66 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1925  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
67 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  53.66 
 
 
75 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  40.58 
 
 
326 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  38.46 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  27.54 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  34 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  35.29 
 
 
329 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  44.44 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  40.58 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  44.44 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  28.99 
 
 
66 aa  40  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.49 
 
 
69 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2198  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.78 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259042  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10421  sulfur carrier protein ThiS  51.28 
 
 
68 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117678  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  39.13 
 
 
70 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>