More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1936 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1936  D-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 		 429 aa  857    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1545  D-amino-acid dehydrogenase  61.31 
 
 		 406 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1999  D-amino-acid dehydrogenase  55.5 
 
 		 403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4738  D-amino-acid dehydrogenase  59.17 
 
 		 408 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0069  D-amino-acid dehydrogenase  56.2 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4229  D-amino-acid dehydrogenase  45.59 
 
 		 415 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.825619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  46.04 
 
 		 416 aa  315  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2001  D-amino-acid dehydrogenase  43.3 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0215  putative D-amino acid dehydrogenase 2, small subunit  46.14 
 
 		 415 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1933  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  46.14 
 
 		 415 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1670  hypothetical protein  46.14 
 
 		 415 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0305  putative D-amino acid dehydrogenase 2, small subunit  46.14 
 
 		 415 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1236  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  46.14 
 
 		 415 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2211  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  46.14 
 
 		 415 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0948  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  45.89 
 
 		 415 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1385  D-amino-acid dehydrogenase  41.75 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.71736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2074  D-amino acid dehydrogenase small subunit  43.49 
 
 		 422 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0223  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  46.21 
 
 		 445 aa  275  9e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3716  D-amino-acid dehydrogenase  41.11 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276162 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4441  D-amino acid dehydrogenase 2 small subunit  42.82 
 
 		 417 aa  269  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136724  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67150  putative oxidoreductase  43.16 
 
 		 416 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2864  D-amino-acid dehydrogenase  39.76 
 
 		 417 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.30815  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2467  D-amino acid dehydrogenase small subunit  43.72 
 
 		 422 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0700  D-amino acid dehydrogenase small subunit  41.73 
 
 		 425 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5823  putative oxidoreductase  43.65 
 
 		 416 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5290  D-amino-acid dehydrogenase  40.87 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2589  D-amino acid dehydrogenase small subunit  42.82 
 
 		 426 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2262  D-amino acid dehydrogenase small subunit  44.66 
 
 		 425 aa  253  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.66021  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1408  D-amino-acid dehydrogenase  39.01 
 
 		 422 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.15 
 
 		 418 aa  239  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0751  D-amino-acid dehydrogenase  37.35 
 
 		 433 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.56 
 
 		 416 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.43 
 
 		 416 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3877  D-amino-acid dehydrogenase  40.15 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3159  D-amino-acid dehydrogenase  37.44 
 
 		 436 aa  226  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4311  D-amino-acid dehydrogenase  40.35 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1546  FAD dependent oxidoreductase  37.99 
 
 		 419 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2380  D-amino-acid dehydrogenase  36.67 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0948  D-amino-acid dehydrogenase  36.06 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3886  D-amino-acid dehydrogenase  37.2 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.694538 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3520  D-amino-acid dehydrogenase  37.44 
 
 		 444 aa  223  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.553559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1556  D-amino-acid dehydrogenase  40.2 
 
 		 397 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2082  D-amino-acid dehydrogenase  33.33 
 
 		 418 aa  220  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0148  D-amino-acid dehydrogenase  35.55 
 
 		 445 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.739629  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0528  D-amino-acid dehydrogenase  36.93 
 
 		 443 aa  220  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0091768  hitchhiker  0.00000110387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  36.06 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.32 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0090  D-amino-acid dehydrogenase  34.52 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0071  D-amino-acid dehydrogenase  34.52 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1542  D-amino acid dehydrogenase small subunit  39.31 
 
 		 420 aa  217  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.224585  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0673  D-amino-acid dehydrogenase  36.17 
 
 		 417 aa  216  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180164  hitchhiker  0.00553067 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2093  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.99 
 
 		 416 aa  216  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59754  normal  0.0350619 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.19 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.58 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5009  D-amino-acid dehydrogenase  34.37 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0558  D-amino-acid dehydrogenase small subunit  32.94 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  34.86 
 
 		 439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0131  D-amino-acid dehydrogenase  34.05 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.814059  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03073  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.92 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.57 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3638  D-amino-acid dehydrogenase  38.42 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3113  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.57 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4507  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.04 
 
 		 439 aa  210  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.37 
 
 		 416 aa  209  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  32.93 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.47 
 
 		 428 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.92 
 
 		 428 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.38 
 
 		 428 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0886  FAD dependent oxidoreductase  37.17 
 
 		 439 aa  206  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204512 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.62 
 
 		 428 aa  206  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.38 
 
 		 428 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.53 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.38 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.38 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.38 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.38 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.38 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.38 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.38 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3589  D-amino-acid dehydrogenase  33.99 
 
 		 424 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0959455  hitchhiker  0.00000935542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0369  D-amino-acid dehydrogenase  34.39 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0122  D-amino-acid dehydrogenase  35.92 
 
 		 407 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.49 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.76 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0094  D-amino-acid dehydrogenase  33.72 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2000  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.29 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.881788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.82 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0740  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.22 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.968608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.8 
 
 		 432 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.46 
 
 		 434 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.17 
 
 		 416 aa  199  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.17 
 
 		 416 aa  199  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.05 
 
 		 435 aa  199  7e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.385338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.25 
 
 		 441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.69 
 
 		 416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  35.63 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.57 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4473  D-amino-acid dehydrogenase  35.51 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.05 
 
 		 433 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>