More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0206 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0206  aminotransferase, class V  100 
 
 		 461 aa  930    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3931  aminotransferase class V  70.84 
 
 		 438 aa  632  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6253  aminotransferase, class V  63.81 
 
 		 440 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5603  aminotransferase, class V  63.28 
 
 		 419 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5967  aminotransferase, class V  63.28 
 
 		 419 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444483 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6467  aminotransferase class V  63.05 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766893 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1280  aminotransferase class V  32.63 
 
 		 421 aa  228  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.539705  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1680  selenocysteine lyase-like protein  27.75 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  24.83 
 
 		 411 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  24.25 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  24.82 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  23.67 
 
 		 410 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  24.77 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  23.96 
 
 		 409 aa  86.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  24.82 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  27.68 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  22.93 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  23.73 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  23.74 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  24.48 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  25.07 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  21.53 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  24.57 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  25.91 
 
 		 496 aa  73.2  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  37.21 
 
 		 441 aa  73.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  25.87 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.51 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  25.54 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.89 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.47 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1335  aminotransferase, class V  25.31 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.51 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1527  cysteine sulfinate desulfinase  25.47 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  30.53 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  24.03 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.1 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0924  aminotransferase class V  23.47 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000281002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  23.21 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1547  aminotransferase class V  25.89 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  22.96 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  22.96 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  22.96 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  22.96 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  25.78 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.22 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  23.81 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  22.96 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.15 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  22.96 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.62 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.89 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  22.96 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.27 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  22.96 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  23.3 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  24.67 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.58 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.89 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.56 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1092  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  23.88 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  21.3 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.91 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.21 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  23.21 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.2 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.57 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.62 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3060  aminotransferase, class V  28.66 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.349128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  27.07 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.11 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.75 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  24.44 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.33 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.98 
 
 		 664 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1569  cysteine desulfurase IscS  29.17 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0713  Cysteine desulfurase  26.09 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.29 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26810  cysteine desulfurase  28.19 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.18 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.46 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.53 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.73 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  29.69 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  24.47 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.42 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.78 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.52 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.31 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  31.01 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  23.01 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  31.79 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2142  NifS-related protein  26.07 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  21.66 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  26.34 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  26.79 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.22 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4855  Cysteine desulfurase  31.15 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.869164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.7 
 
 		 644 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2511  aminotransferase, class V  23.71 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  24.59 
 
 		 387 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>