More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4855 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4855  Cysteine desulfurase  100 
 
 
461 aa  938    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.869164 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.64 
 
 
425 aa  236  9e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.43 
 
 
414 aa  233  6e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  35.89 
 
 
414 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.51 
 
 
415 aa  227  4e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.02 
 
 
414 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  34.23 
 
 
404 aa  226  8e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34 
 
 
414 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  34.67 
 
 
405 aa  224  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.01 
 
 
415 aa  223  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.67 
 
 
451 aa  222  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.14 
 
 
409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.96 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  34.59 
 
 
420 aa  220  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  34.05 
 
 
410 aa  218  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.97 
 
 
412 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.54 
 
 
417 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.58 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.48 
 
 
414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  36.26 
 
 
419 aa  213  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.11 
 
 
419 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.09 
 
 
414 aa  213  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  33.93 
 
 
626 aa  213  7.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.88 
 
 
419 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.38 
 
 
412 aa  212  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  34.08 
 
 
420 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.48 
 
 
417 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.89 
 
 
414 aa  211  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.45 
 
 
414 aa  211  3e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.92 
 
 
419 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  32.74 
 
 
414 aa  210  4e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.89 
 
 
413 aa  209  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.86 
 
 
406 aa  209  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.1 
 
 
443 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  33.73 
 
 
425 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.89 
 
 
415 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  34.59 
 
 
414 aa  208  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.58 
 
 
420 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.62 
 
 
414 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  33.71 
 
 
604 aa  207  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  34.13 
 
 
424 aa  207  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  33.71 
 
 
604 aa  207  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  33.63 
 
 
421 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.52 
 
 
420 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.52 
 
 
406 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.81 
 
 
412 aa  206  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.67 
 
 
409 aa  206  9e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.76 
 
 
421 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.39 
 
 
419 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  31.75 
 
 
410 aa  204  3e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  33.72 
 
 
423 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  31.04 
 
 
408 aa  204  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.15 
 
 
410 aa  203  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.75 
 
 
425 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  35.14 
 
 
422 aa  203  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.86 
 
 
406 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.86 
 
 
406 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  33.03 
 
 
420 aa  202  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.86 
 
 
406 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.78 
 
 
413 aa  202  9e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.23 
 
 
413 aa  202  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.95 
 
 
408 aa  202  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.58 
 
 
428 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.86 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.51 
 
 
435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.86 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.68 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.15 
 
 
406 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.33 
 
 
418 aa  201  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.56 
 
 
417 aa  200  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.33 
 
 
418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.43 
 
 
433 aa  200  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  31.73 
 
 
417 aa  200  5e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  33.64 
 
 
417 aa  199  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.17 
 
 
621 aa  200  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.84 
 
 
408 aa  199  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  31.17 
 
 
419 aa  199  7.999999999999999e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.48 
 
 
413 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.55 
 
 
413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.96 
 
 
560 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.86 
 
 
413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.51 
 
 
406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0462  cysteine desulfurase  32.74 
 
 
407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.49202  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.63 
 
 
419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.15 
 
 
406 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  32.74 
 
 
406 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.6 
 
 
415 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  31.13 
 
 
420 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.16 
 
 
413 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  32.74 
 
 
406 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.84 
 
 
441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  32.74 
 
 
406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.15 
 
 
404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  32.28 
 
 
406 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  32.28 
 
 
406 aa  196  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  33.48 
 
 
682 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.15 
 
 
406 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.38 
 
 
406 aa  196  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  33.26 
 
 
415 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  35.48 
 
 
408 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>