More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0924 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0924  aminotransferase class V  100 
 
 
372 aa  748    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000281002  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  42.78 
 
 
387 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  39.69 
 
 
387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  40.68 
 
 
383 aa  269  7e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  39.24 
 
 
388 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  39.01 
 
 
380 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  36.88 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  37.14 
 
 
381 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  38.08 
 
 
381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  36.08 
 
 
380 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  37.37 
 
 
380 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  38.46 
 
 
395 aa  246  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  36.6 
 
 
380 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  36.6 
 
 
380 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  36.6 
 
 
380 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  36.6 
 
 
380 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  36.6 
 
 
380 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  37.66 
 
 
401 aa  245  8e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1547  aminotransferase class V  35.99 
 
 
382 aa  245  8e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  36.86 
 
 
380 aa  245  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  36.6 
 
 
380 aa  245  9e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  36.6 
 
 
380 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  36.6 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  37.6 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0713  Cysteine desulfurase  38.26 
 
 
380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  37.47 
 
 
398 aa  239  5e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  35.88 
 
 
382 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  39.11 
 
 
394 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  38.18 
 
 
401 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  35.71 
 
 
382 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  37.4 
 
 
398 aa  235  9e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  34.82 
 
 
392 aa  233  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  36.62 
 
 
398 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  32.2 
 
 
388 aa  232  9e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  37.5 
 
 
404 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  36.69 
 
 
401 aa  227  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  36.13 
 
 
406 aa  226  6e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  37.17 
 
 
394 aa  225  8e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  35 
 
 
388 aa  225  9e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0295  Cysteine desulfurase  37.93 
 
 
373 aa  225  9e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  37.05 
 
 
384 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1224  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.47 
 
 
384 aa  224  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000183022  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  36.44 
 
 
384 aa  223  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  35.96 
 
 
400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  33.33 
 
 
392 aa  222  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  36.53 
 
 
384 aa  222  9e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  35.51 
 
 
398 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  35.39 
 
 
380 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  35.62 
 
 
384 aa  219  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  35.94 
 
 
397 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  33.95 
 
 
396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3676  aminotransferase class V  35.43 
 
 
386 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0159839  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0502  aminotransferase, class V  35.55 
 
 
382 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  35.01 
 
 
381 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  37.57 
 
 
377 aa  214  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  36.88 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  33.51 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  35.25 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  32.73 
 
 
422 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  34.38 
 
 
404 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  34.38 
 
 
404 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  34.38 
 
 
404 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  34.38 
 
 
404 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  34.38 
 
 
404 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  34.38 
 
 
404 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  34.38 
 
 
404 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  34.38 
 
 
404 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  34.38 
 
 
404 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  35.05 
 
 
380 aa  211  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  33.33 
 
 
399 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  34.73 
 
 
405 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  33.07 
 
 
384 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  33.16 
 
 
393 aa  210  3e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  34.3 
 
 
383 aa  210  4e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  34.63 
 
 
502 aa  210  4e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  33.25 
 
 
398 aa  210  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  33.85 
 
 
404 aa  210  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1215  aminotransferase class V  33.42 
 
 
390 aa  209  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.727858  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  33.16 
 
 
404 aa  209  8e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  33.85 
 
 
404 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  34.11 
 
 
406 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  33.85 
 
 
404 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  33.85 
 
 
404 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  33.77 
 
 
383 aa  208  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  33.85 
 
 
404 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  33.85 
 
 
390 aa  208  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  33.85 
 
 
382 aa  207  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  34.11 
 
 
404 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  34.47 
 
 
381 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  34.29 
 
 
398 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  33.85 
 
 
404 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  34.72 
 
 
380 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  34.72 
 
 
380 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  35.26 
 
 
381 aa  206  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  34.73 
 
 
403 aa  206  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  35 
 
 
381 aa  206  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  33.59 
 
 
404 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  33.59 
 
 
407 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  32.2 
 
 
405 aa  206  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  34.03 
 
 
396 aa  206  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>