More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0295 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0295  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 373 aa  743    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0713  Cysteine desulfurase  41.58 
 
 		 380 aa  292  6e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  39.95 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1547  aminotransferase class V  40.94 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  38.95 
 
 		 381 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  39.47 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  40.17 
 
 		 387 aa  256  6e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  34.38 
 
 		 382 aa  245  9e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  36.77 
 
 		 404 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  38.63 
 
 		 388 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  36.1 
 
 		 384 aa  238  9e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  37.14 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  37.14 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  36.63 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  35.71 
 
 		 381 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  35.54 
 
 		 381 aa  236  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  39.47 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  37.99 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  39.21 
 
 		 384 aa  230  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08616  iron-sulfur cofactor synthesis protein  37.8 
 
 		 382 aa  229  7e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  34.47 
 
 		 380 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  36.41 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  33.6 
 
 		 407 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  32.98 
 
 		 396 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  33.6 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0924  aminotransferase class V  37.93 
 
 		 372 aa  225  9e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000281002  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  33.16 
 
 		 414 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  31.93 
 
 		 391 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  32.28 
 
 		 404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  32.98 
 
 		 389 aa  222  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  36.03 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  34.73 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  35.77 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  32.28 
 
 		 391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  36.18 
 
 		 395 aa  219  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  32.9 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  32.55 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  34.74 
 
 		 398 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  32.73 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  31.95 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  34.46 
 
 		 404 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  33.86 
 
 		 407 aa  215  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  34.99 
 
 		 392 aa  215  9e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  32.98 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  35.16 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  32.81 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  31.75 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  33.68 
 
 		 493 aa  214  2.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  32.9 
 
 		 411 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  34.25 
 
 		 406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  33.16 
 
 		 507 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  35.96 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  33.07 
 
 		 405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  34.92 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  32.56 
 
 		 398 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  33.68 
 
 		 407 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  33.68 
 
 		 407 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  33.68 
 
 		 407 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  31.58 
 
 		 389 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  30.65 
 
 		 393 aa  212  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1099  aminotransferase class V  35.79 
 
 		 378 aa  212  9e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.386639  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  32.88 
 
 		 406 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  33.68 
 
 		 398 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  33.33 
 
 		 407 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  34.04 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  33.16 
 
 		 398 aa  211  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  32.45 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  36.15 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  33.07 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  33.07 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  34.2 
 
 		 404 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  33.94 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  33.94 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  33.94 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  33.25 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  33.07 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  33.94 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  33.94 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  33.94 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  34.2 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  33.94 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  30.89 
 
 		 400 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  33.94 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  33.33 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  33.94 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  33.33 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  31.94 
 
 		 402 aa  210  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  34.74 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  33.15 
 
 		 406 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  33.07 
 
 		 407 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  33.07 
 
 		 407 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  33.07 
 
 		 407 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  33.42 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  33.68 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  33.07 
 
 		 407 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  33.42 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  33.42 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  33.42 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  33.42 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1122  aminotransferase, class V  29.46 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>