More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1122 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1122  aminotransferase, class V  100 
 
 		 382 aa  776    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  63.45 
 
 		 404 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  63.19 
 
 		 404 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3511  cysteine desulfurase  62.92 
 
 		 404 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1629  cysteine desulfurase IscS  61.2 
 
 		 408 aa  499  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000331255  hitchhiker  0.0000285871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0842  cysteine desulfurase  62.66 
 
 		 404 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0648359  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1423  cysteine desulfurase  61.36 
 
 		 404 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1237  cysteine desulfurase  61.36 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.781022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  60.31 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0872  cysteine desulfurase  62.66 
 
 		 404 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40400  cysteine desulfurase  62.66 
 
 		 404 aa  494  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  62.66 
 
 		 404 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  60.57 
 
 		 404 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  60.31 
 
 		 404 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0885  cysteine desulfurase  62.66 
 
 		 404 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306655  hitchhiker  0.00050858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  59.01 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  59.01 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  59.01 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  59.01 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  58.75 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  59.01 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4612  cysteine desulfurase  60.57 
 
 		 404 aa  488  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0217102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  60.31 
 
 		 404 aa  490  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  59.01 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  60.05 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  59.01 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  59.01 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  59.01 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  58.49 
 
 		 404 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  59.53 
 
 		 404 aa  484  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  58.49 
 
 		 404 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  60.05 
 
 		 404 aa  484  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  58.75 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  59.53 
 
 		 404 aa  485  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  58.49 
 
 		 404 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  58.49 
 
 		 404 aa  484  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  59.53 
 
 		 404 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  58.49 
 
 		 404 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  59.01 
 
 		 404 aa  487  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  58.75 
 
 		 404 aa  482  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  58.49 
 
 		 404 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  58.22 
 
 		 404 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  59.01 
 
 		 404 aa  484  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  59.27 
 
 		 404 aa  484  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  58.49 
 
 		 404 aa  482  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  59.27 
 
 		 404 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1477  putative cysteine desulfurase  59.74 
 
 		 408 aa  479  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.339117  hitchhiker  0.000732384 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  59.53 
 
 		 404 aa  480  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1656  cysteine desulfurase IscS  60 
 
 		 408 aa  479  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0819836  unclonable  0.0000556983 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0435  cysteine desulfurase  58.49 
 
 		 409 aa  474  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194235 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  59.01 
 
 		 404 aa  476  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1351  aminotransferase class V  61.36 
 
 		 384 aa  474  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000567164 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  57.96 
 
 		 406 aa  477  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1276  cysteine desulfurase  58.75 
 
 		 409 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00157162  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1168  cysteine desulfurase  58.75 
 
 		 409 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00941489  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1961  cysteine desulfurase  58.49 
 
 		 404 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.037165  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2386  cysteine desulfurase  58.22 
 
 		 404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000240874  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2397  cysteine desulfurase  58.22 
 
 		 404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0798953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2502  cysteine desulfurase  58.22 
 
 		 404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893038  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  59.16 
 
 		 406 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  58.49 
 
 		 407 aa  465  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0247  cysteine desulfurase  60.05 
 
 		 403 aa  461  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  57.7 
 
 		 404 aa  464  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  58.85 
 
 		 405 aa  464  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  59.01 
 
 		 407 aa  458  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  58.16 
 
 		 407 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01356  cysteine desulfurase  57.74 
 
 		 388 aa  460  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  57.89 
 
 		 407 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2848  aminotransferase, class V  60.89 
 
 		 382 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1324  cysteine desulfurase IscS  57.44 
 
 		 403 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00549463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  57.11 
 
 		 407 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  57.37 
 
 		 407 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  57.63 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  57.89 
 
 		 407 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0006  cysteine desulfurase  56.92 
 
 		 384 aa  456  1e-127  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  57.37 
 
 		 407 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  57.89 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  55.35 
 
 		 404 aa  454  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  57.63 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  57.37 
 
 		 407 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  57.89 
 
 		 407 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  57.89 
 
 		 407 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  58.53 
 
 		 405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  57.37 
 
 		 407 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  57.89 
 
 		 407 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  56.84 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  57.11 
 
 		 406 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  59.32 
 
 		 408 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  57.89 
 
 		 407 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  57.11 
 
 		 407 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  57.59 
 
 		 407 aa  448  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  56.58 
 
 		 405 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1413  cysteine desulfurase  58.29 
 
 		 407 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.156038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1238  cysteine desulfurase IscS  56.14 
 
 		 407 aa  450  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.01856  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  57.59 
 
 		 421 aa  448  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  57.11 
 
 		 407 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  56.58 
 
 		 405 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  57.11 
 
 		 406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  58.16 
 
 		 406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  58.16 
 
 		 406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>