63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1695 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0257  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  88.98 
 
 		 366 aa  686    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.513383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1695  conjugal transfer protein  100 
 
 		 381 aa  770    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1393  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  92.65 
 
 		 371 aa  712    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2510  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.69 
 
 		 260 aa  99.8  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.108506  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1696  conjugal transfer protein, putative  27.5 
 
 		 333 aa  93.2  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1394  hypothetical protein  26.99 
 
 		 338 aa  90.5  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.358274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0258  hypothetical protein  26.25 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.289071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4696  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.74 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  26.58 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  27.45 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6507  conjugal transfer protein TrbG  22.78 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0761422  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4269  conjugal transfer protein TrbG  22.78 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166546  normal  0.0145862 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6630  conjugal transfer protein TrbG  22.78 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.5 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7448  putative conjugal transfer protein trbG  33.64 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3992  P-type conjugative transfer protein TrbG  35.79 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0363697  normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3835  P-type conjugative transfer protein TrbG  36.17 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0052  conjugal transfer protein TrbG  22.87 
 
 		 295 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1005  P-type conjugative transfer protein TrbG  35.11 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.94 
 
 		 357 aa  53.9  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2092  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.41 
 
 		 339 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2034  P-type conjugative transfer protein TrbG  33.33 
 
 		 327 aa  53.1  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8325  conjugal transfer protein TrbG  26.2 
 
 		 284 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000831167  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  25.84 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0603  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.7 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2886  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.19 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0741  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.19 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3893  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.91 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3094  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.19 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.13 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.85 
 
 		 339 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0310  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.33 
 
 		 343 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5490  conjugal transfer protein TrbG  25.09 
 
 		 273 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3533  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.97 
 
 		 346 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3699  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.19 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7749  putative conjugal transfer protein trbG  34.72 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.0621057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.1 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  30.1 
 
 		 329 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2691  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.1 
 
 		 333 aa  47.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.33 
 
 		 328 aa  47  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.1 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250287  normal  0.746968 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.13 
 
 		 330 aa  46.6  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.29 
 
 		 329 aa  46.6  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.03 
 
 		 318 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.1 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  33.33 
 
 		 326 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  33.33 
 
 		 326 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.1 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.68 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  34.72 
 
 		 326 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.1 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.1 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.1 
 
 		 333 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  28.16 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.13 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1476  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.63 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.71 
 
 		 326 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.43 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1290  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.7 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.69 
 
 		 333 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2478  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.71 
 
 		 283 aa  43.9  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197669  normal  0.278704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.56 
 
 		 333 aa  43.5  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.89 
 
 		 338 aa  43.1  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>