68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0257 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0257  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  100 
 
 		 366 aa  742    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.513383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1393  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  94.88 
 
 		 371 aa  712    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1695  conjugal transfer protein  88.71 
 
 		 381 aa  680    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1696  conjugal transfer protein, putative  28.38 
 
 		 333 aa  96.7  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1394  hypothetical protein  27.92 
 
 		 338 aa  95.9  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.358274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0258  hypothetical protein  28.05 
 
 		 336 aa  94  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.289071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2510  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.73 
 
 		 260 aa  89.4  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.108506  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4696  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.14 
 
 		 292 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4269  conjugal transfer protein TrbG  23.4 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166546  normal  0.0145862 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6507  conjugal transfer protein TrbG  23.4 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0761422  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6630  conjugal transfer protein TrbG  23.4 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  28.63 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  28.24 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0052  conjugal transfer protein TrbG  23.46 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7448  putative conjugal transfer protein trbG  36.63 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.88 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8325  conjugal transfer protein TrbG  27.95 
 
 		 284 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000831167  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1005  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.11 
 
 		 328 aa  57  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  26.48 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3992  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.69 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0363697  normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.45 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2092  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.82 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2034  P-type conjugative transfer protein TrbG  34.41 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3835  P-type conjugative transfer protein TrbG  35.11 
 
 		 341 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  25 
 
 		 339 aa  53.5  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3893  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.57 
 
 		 334 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.85 
 
 		 357 aa  52.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3094  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.81 
 
 		 355 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5490  conjugal transfer protein TrbG  26.19 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0603  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.46 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0310  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  34.44 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2886  P-type conjugative transfer protein TrbG  32.98 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0741  P-type conjugative transfer protein TrbG  32.98 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3533  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.2 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  22.55 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3699  P-type conjugative transfer protein TrbG  33.7 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1666  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.58 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  22.79 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.04 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7749  putative conjugal transfer protein trbG  34.72 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.0621057 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2230  conjugal transfer protein TrbG  23.5 
 
 		 296 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.938965  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.79 
 
 		 334 aa  47  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.68 
 
 		 330 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.33 
 
 		 328 aa  46.6  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1476  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.29 
 
 		 342 aa  46.2  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.79 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250287  normal  0.746968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  33.33 
 
 		 326 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  33.33 
 
 		 326 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.85 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  29.79 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.33 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  34.72 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2691  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.79 
 
 		 333 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.85 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  22.53 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.24 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5384  conjugal transfer protein TrbG  25.33 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0585815 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.89 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.79 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.79 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.72 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2478  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.52 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197669  normal  0.278704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.52 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  27.66 
 
 		 334 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.26 
 
 		 326 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.43 
 
 		 333 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1712  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.84 
 
 		 314 aa  43.1  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000367277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1290  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.35 
 
 		 330 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>