More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1059 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1059  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
364 aa  692    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.866194  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1056  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  98.08 
 
 
364 aa  678    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0998  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  95.33 
 
 
364 aa  630  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1572  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  80.77 
 
 
363 aa  521  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00359628 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0054  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  52.49 
 
 
361 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  42.48 
 
 
355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.25 
 
 
359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  33.14 
 
 
380 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  37.88 
 
 
347 aa  217  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  41.78 
 
 
366 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  38.55 
 
 
366 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  47.5 
 
 
352 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  32.47 
 
 
380 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  36.86 
 
 
378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.59 
 
 
352 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  41.38 
 
 
380 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  38.59 
 
 
357 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  35.15 
 
 
348 aa  209  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0256  ABC transporter-related protein  43.24 
 
 
349 aa  209  7e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  34.47 
 
 
385 aa  209  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  48.34 
 
 
354 aa  209  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  43.19 
 
 
361 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  40.29 
 
 
363 aa  206  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.65 
 
 
353 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  44.52 
 
 
365 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7799  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.29 
 
 
384 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  47.7 
 
 
351 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  44.6 
 
 
410 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1878  molybdate ABC transporter ATPase  37.12 
 
 
357 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  35.9 
 
 
343 aa  203  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  42.35 
 
 
355 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  37.99 
 
 
353 aa  203  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.22 
 
 
378 aa  203  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  42.35 
 
 
355 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  42.35 
 
 
355 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  42.35 
 
 
355 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  42.07 
 
 
353 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  42.35 
 
 
355 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  42.35 
 
 
355 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  46.89 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  42.95 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  49.42 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.35 
 
 
362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0301  ABC transporter related  34.1 
 
 
386 aa  200  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  36.21 
 
 
349 aa  200  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.26 
 
 
378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  45.39 
 
 
347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3275  ABC transporter related  43.56 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.197934 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  36.47 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  46.42 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  36.21 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  49.58 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1587  ABC transporter related  46.01 
 
 
366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.71 
 
 
372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.49 
 
 
372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1403  ABC transporter related protein  34.55 
 
 
351 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.579406  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  46.42 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  48.35 
 
 
376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  43.82 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  42.81 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  36.21 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  42.81 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.82 
 
 
352 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  45.49 
 
 
386 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  41.44 
 
 
360 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.36 
 
 
378 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  41.44 
 
 
360 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  36.21 
 
 
349 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  39.12 
 
 
356 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  38.58 
 
 
349 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  43.03 
 
 
355 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.41 
 
 
377 aa  197  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  39.38 
 
 
369 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  41.78 
 
 
353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  43.82 
 
 
355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  42.52 
 
 
374 aa  196  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  43.82 
 
 
355 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  38.27 
 
 
349 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 
356 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
349 aa  196  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  45.05 
 
 
343 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  41.24 
 
 
355 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  38.27 
 
 
349 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.19 
 
 
362 aa  196  6e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.03 
 
 
355 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.21 
 
 
370 aa  195  8.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1222  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.54 
 
 
363 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.01 
 
 
378 aa  195  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.01 
 
 
378 aa  195  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.01 
 
 
378 aa  195  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  46.06 
 
 
355 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.01 
 
 
378 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.01 
 
 
378 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0289  ABC transporter ATP-binding protein  43.54 
 
 
370 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  35.48 
 
 
335 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.01 
 
 
378 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  35.92 
 
 
349 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  45.66 
 
 
359 aa  195  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.01 
 
 
378 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>