More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0734 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0734  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 115 aa  235  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0733  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 115 aa  235  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.721245  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0698  histone-like DNA-binding protein  97.41 
 
 		 116 aa  225  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0740  histone family protein DNA-binding protein  83.33 
 
 		 126 aa  205  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1870  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502599 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1425  histone family protein DNA-binding protein  50.54 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.589972  normal  0.158617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1746  integration host factor, beta subunit  53.33 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1833  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 93 aa  100  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 91 aa  100  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1850  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 93 aa  100  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1799  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000246385  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2156  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2060  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1455  BHL, histone-like protein  52.75 
 
 		 92 aa  98.6  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000108393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1012  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000010655  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3213  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 91 aa  95.9  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1781  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.88683  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1941  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3207  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3240  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 168 aa  91.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.935864 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0558  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235916 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 93 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3254  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 93 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00043696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1468  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 93 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1299  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 93 aa  90.1  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184081  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0397  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 91 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1783  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3890  histone family protein DNA-binding protein  47.73 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00577946  normal  0.782973 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  44.68 
 
 		 95 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  43.96 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  40.71 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  43.69 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1351  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  83.6  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0471037  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1371  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1880  nucleoid DNA-binding protein  41.3 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0461  histone family protein DNA-binding protein  39.77 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.376006  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0153  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1185  histone-like DNA-binding protein  45.35 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0148  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395454  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0165  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0424  histone family protein DNA-binding protein  39.77 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149855  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  40 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  43.96 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  42.39 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  42.39 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  42.39 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  42.39 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3286  histone family protein DNA-binding protein  43.48 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1724  histone-like DNA-binding protein  37.37 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.142965  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1426  histone family protein DNA-binding protein  39.29 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  41.76 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  42.39 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  42.39 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0356  histone family protein DNA-binding protein  39.77 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0204  integration host factor, beta subunit  42.39 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  42.11 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0101  integration host factor subunit beta  41.3 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  45.74 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0395  integration host factor subunit beta  41.3 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  45.74 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116436  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2127  histone family protein DNA-binding protein  37.78 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.053559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2501  integration host factor, beta subunit  38.24 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  39.47 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  40.66 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0905  integration host factor, beta subunit  45.36 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.809702  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0059  integration host factor subunit beta  39.56 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2470  integration host factor, beta subunit  42.86 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.391555  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0043  integration host factor subunit beta  39.56 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.621323  normal  0.262305 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1890  histone family protein DNA-binding protein  40.45 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.469333  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1026  integration host factor, beta subunit  45.36 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00129538  unclonable  0.0000000000260989 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1390  integration host factor, beta subunit  42.86 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1565  histone-like DNA-binding protein  41.76 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2444  integration host factor, beta subunit  40.66 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0409  integration host factor subunit beta  39.56 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  39.47 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0021  integration host factor subunit beta  39.56 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0180  histone family protein DNA-binding protein  38.46 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75268  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  40.43 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2314  histone family protein DNA-binding protein  36.46 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800126  normal  0.266059 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0238  histone family protein DNA-binding protein  37.36 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2198  integration host factor, beta subunit  37.25 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5428  integration host factor, beta subunit  42.53 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3125  histone family protein DNA-binding protein  36.11 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0598577  decreased coverage  0.00823154 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  41.9 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2568  integration host factor subunit beta  40 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2356  histone family protein DNA-binding protein  37.78 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2409  histone family protein DNA-binding protein  38.46 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1788  integration host factor, beta subunit  40.66 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860483 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  43.33 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  36.73 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>