More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3207 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3207  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1941  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1455  BHL, histone-like protein  58.89 
 
 		 92 aa  114  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000108393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1746  integration host factor, beta subunit  56.04 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1799  histone-like DNA-binding protein  56.67 
 
 		 91 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000246385  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1012  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 91 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000010655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1833  histone-like DNA-binding protein  55.56 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 		 91 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1870  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502599 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0558  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235916 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1850  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 93 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3213  histone-like DNA-binding protein  54.44 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1299  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184081  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2060  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2156  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1781  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.88683  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0397  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3240  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 168 aa  98.2  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.935864 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1783  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3890  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00577946  normal  0.782973 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0740  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1425  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.589972  normal  0.158617 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0698  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 116 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151806  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0734  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0733  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.721245  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1890  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.469333  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1468  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  47.25 
 
 		 92 aa  87.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  87.4  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  48.35 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  47.25 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  43.96 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0165  histone-like DNA-binding protein  45.05 
 
 		 93 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  42.22 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  41.11 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  46.74 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  46.74 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  42.39 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0461  histone family protein DNA-binding protein  42.05 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.376006  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  43.48 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  42.39 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1426  histone family protein DNA-binding protein  41.67 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3254  histone family protein DNA-binding protein  42.39 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00043696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  42.39 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0501  integration host factor, beta subunit  54.55 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525141  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0427  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.496954  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2881  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601006  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2992  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1639  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.79916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2571  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.444385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2944  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.846703  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0202  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0946  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2568  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0747  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1007  integration host factor subunit beta  45.65 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4161  integration host factor subunit beta  45.65 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1048  integration host factor subunit beta  45.65 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0569  integration host factor subunit beta  45.65 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1351  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  80.1  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0471037  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  40.22 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  39.33 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  41.3 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  44.57 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  43.68 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>