More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0558 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0558  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235916 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1299  histone family protein DNA-binding protein  85.71 
 
 		 93 aa  164  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184081  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1799  histone-like DNA-binding protein  83.52 
 
 		 91 aa  156  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000246385  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1941  histone family protein DNA-binding protein  72.22 
 
 		 91 aa  141  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3213  histone-like DNA-binding protein  71.11 
 
 		 91 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1783  histone family protein DNA-binding protein  68.89 
 
 		 91 aa  133  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1870  histone family protein DNA-binding protein  70 
 
 		 91 aa  130  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502599 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0397  histone family protein DNA-binding protein  68.89 
 
 		 91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1012  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000010655  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3207  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  56.32 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1850  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 93 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2156  histone family protein DNA-binding protein  56.32 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1425  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.589972  normal  0.158617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3240  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.935864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1455  BHL, histone-like protein  54.44 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000108393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1746  integration host factor, beta subunit  57.47 
 
 		 92 aa  104  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1833  histone-like DNA-binding protein  53.85 
 
 		 93 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3890  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00577946  normal  0.782973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2060  histone family protein DNA-binding protein  55.17 
 
 		 91 aa  103  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1781  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.88683  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 98 aa  92.8  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0734  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 115 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0698  histone-like DNA-binding protein  47.78 
 
 		 116 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151806  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0733  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 115 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.721245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0740  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 126 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  47.25 
 
 		 95 aa  90.5  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1351  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0471037  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 94 aa  88.2  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  46.15 
 
 		 96 aa  87.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  47.83 
 
 		 98 aa  87.8  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2127  histone family protein DNA-binding protein  44.83 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.053559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  42.53 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0409  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0043  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.621323  normal  0.262305 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  40 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0723  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0059  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  45.65 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1880  nucleoid DNA-binding protein  48.86 
 
 		 94 aa  84.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  41.38 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0021  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  41.76 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  39.08 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  41.38 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  41.38 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  41.38 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  41.38 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  41.38 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1468  histone family protein DNA-binding protein  44.57 
 
 		 93 aa  84.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0905  integration host factor, beta subunit  46.59 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.809702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  41.38 
 
 		 90 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  41.38 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  42.86 
 
 		 92 aa  84  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  41.38 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  46.74 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  41.38 
 
 		 90 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1026  integration host factor, beta subunit  46.59 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00129538  unclonable  0.0000000000260989 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  41.38 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1890  histone family protein DNA-binding protein  48.28 
 
 		 90 aa  84.3  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.469333  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 95 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2568  integration host factor subunit beta  48.86 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 93 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0101  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  43.96 
 
 		 95 aa  83.6  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 93 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 100 aa  83.6  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0395  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 101 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2928  integration host factor, beta subunit  43.48 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 93 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  42.86 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  43.48 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  41.38 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0165  histone-like DNA-binding protein  43.96 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  45.65 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3254  histone family protein DNA-binding protein  45.65 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00043696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>